上期我们与大家一起分析鉴定了支原体样本，

今天继续来看看剩下的细菌样本。

江湖上流传很久的黑胶虫，到底真实身份是啥？

我们一起来扒一扒~

 

逍鹏生物收集了全国29个黑胶虫污染样本进行DNA提取、测序、数据库比对，得到鉴定结果。

在这29个样本中，有11个样本鉴定为支原体，种类分别为猪鼻支原体、牛支原体、鼠肺支原体、山羊支原体。18个样本鉴定为细菌，种类分别为放线菌属、罗尔斯通菌属、短波单胞菌属、泳池芽殖单胞菌、假单胞菌、鞘氨醇单胞菌、甲基菌属、微杆菌属、赫氏草螺菌。

接下来我们分析一下剩余的18个被鉴定为细菌的黑胶虫样本

首先我们来了解一下细菌基本特征

 

# 细菌污染 #

定义：一类细胞细短，结构简单，胞壁坚韧，多以二分裂方式繁殖和水生性强的原核生物。

结构：主要是单细胞的原核生物，有球形，杆形，螺旋形，放线形。基本结构：细胞膜、细胞壁、细胞质、拟核。特殊结构：荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。大家注意，鞭毛多一些游动相对活跃，鞭毛少一些可能会原地大钻，颤动，这就和我们观察到的黑胶虫现象相吻合了。

繁殖：多数细菌主要以二分裂方式进行繁殖。
 

图7. 菌落图
图源网络，仅供参考学习用

这里有一些菌落的形态供大家欣赏一下，不同的微生物形成的菌落在形态、突起、边缘上具有不同的特征，是鉴别菌种的重要依据。
 

酵母菌和霉菌属于真菌，有成型的细胞核，放线菌和大肠杆菌属于细菌，两者有本质的区别，前者有核膜包围的细胞核，后者没有。酵母菌的菌落呈白色光滑原斑；霉菌的菌落相对其它菌都比较大，会呈现青绿、灰黑等颜色；放线菌菌落呈明显的放射状，菌落也相对较大；大肠杆菌的菌落呈白色小圆点，和酵母菌菌落有相似之处。

 

图8. 细菌形态（来源：百度百科）

 

细菌主要有两种划分标准。

根据形状主要分为三类：球菌、杆菌、螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺杆菌）；

 

图9. 革兰氏阳性菌

图源网络，仅供参考学习用

 

根据细胞壁的组成成分又分为革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。丹麦细菌学家革兰（Hans Christian Gram），他发明了革兰氏染色。经过染色细菌仍然保留初染结晶紫的蓝紫色为革兰氏阳性菌，经过染色细菌脱去了初染结晶紫的颜色，带上了蕃红或沙黄的红色为革兰氏阴性菌。

 

放线菌属  //

图10. Actinobacterium sp.（放线菌属）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本3 为 Actinobacterium sp.（放线菌属）

类别：G+菌

形状：丝状；菌落呈放射状

大小：宽度近于杆状细菌，直径0.5~1 μm

代表属：链霉菌属，多达1000多种，大家所熟知的链霉素就是其代谢产物

分布范围：土壤、空气和水中，尤其是含水量低、有机物丰富、呈中性或微碱性的土壤中数量最多。土壤特有的泥腥味，主要是放线菌的代谢产物所致

 

 

罗尔斯通菌属  //

图11. Ralstonia sp.（罗尔斯通菌属）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本4 定序为 Ralstonia sp.（罗尔斯通菌属）

类别：G-菌

形状：杆状；菌落呈圆形脐状凸起，无色透明，表面光滑湿润，边缘不规则

大小：1.2×2.5~3.5 μm

代表种：植物青枯菌，寄主范围很广泛，可以侵染茄科、豆科、蓼科、紫草科、凤仙花科等44科200多种植物。除烟草外，番茄、花生、辣椒、茄子、芝麻、生姜、马铃薯以及棉、木麻黄、油橄榄、桑都可受感染，但不危害禾本科植物

分布范围：土壤和水等环境源中

 

 

短波单胞菌属  //

图12. Brevundimonas vesicularis（泡囊假单胞菌）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本5 为 Brevundimonas sp.（短波单胞菌属）

类别：G-菌

形状：杆状；菌落为圆形，凸起，表面湿润光滑，边缘整齐

大小：0.4~0.5x1-2 μm

代表种：泡囊短波单胞菌是一种较罕见的非发酵性病原性假单胞菌，在人体可引起肺炎、败血症、皮肤炎症和坏死性蜂窝织炎等

分布范围：通常存在于土壤、河流等自然界中

 

 

泳池芽殖单胞菌  //

图13. Blastomonas（芽单胞菌属）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本13 为 Blastomonas natatoria（泳池芽殖单胞菌）

类别：G-菌

形状：卵圆形或杆状，含有黄色或橙褐色色素。与芽单胞菌属关系：泳池芽殖单胞菌是芽单胞菌属的一种，通过出芽方式繁殖

分布范围：通常存在于土壤、河流等自然界中

 

 

假单胞菌属  //

图14. Pseudomonas （假单胞菌属）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本27 定序为 Pseudomonas sp.（假单胞菌属

类别：G-菌

形状：杆状；菌落多呈蓝绿色或荧光色，有生姜味

大小：(0.5～1)×(1.5～4) μm

代表种：假单胞菌属种类繁多，含有200余种。代表种绿脓假单胞菌，因能产生绿色水溶性色素，感染创口时可形成绿色脓液而得名。本菌是条件性致病菌，一般为继发性感染，如大面积烧伤的创面感染、中耳炎、泌尿系统感染感染，甚至败血症

分布范围：主要分布在水、土壤和空气中，在临床标本如伤口创面分泌物、脓汁、血液等检出率较高，是医院内感染常见的条件致病菌

 

 

鞘脂菌属  //

图15. Sphingobium（鞘脂菌属）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本2 定序为 Sphingobium sp.（鞘脂菌属）

类别：G-菌

形状：杆状; 菌落直径1.0-2.0mm，黄色，圆形

大小： (0.5～1)×(1.5～4) μm

特点：该细菌严格好氧，无芽孢，生长温度为10-40 ℃;最适生长温度为30-37 ℃。生长的pH值范围是5.5-9.0，最佳pH值在6.5到8.0之间

分布范围：主要从土壤中分离

 

 

鞘氨醇单胞菌属  //

图16. Sphingomonas（鞘氨醇单胞菌）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本7，8，11，23 为 Sphingomonas sp.（鞘氨醇单胞菌）

类别：G-菌

形状：杆状；菌落为黄色

大小：0.3-0.8x1.0-2.7 µm

特点：该菌属至今共有12个种，是一类丰富的新型微生物资源，可用于芳香化合物的生物降解。该属菌株凭借自身的高代谢能力与多功能的生理特性，在环境保护及工业生产方面具有巨大的应用潜力

分布范围：鞘氨醇单胞菌在环境中无处不在，河水、根际、地表及深层的地下的沉积物、海洋，甚至极地土壤中都有它们的踪迹

 

 

甲基芽孢杆菌属  //

图17. Methylobacillus sp（甲基芽孢杆菌属）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本16 为Methylobacillus sp.（甲基芽孢杆菌属）

类别：G-菌

形状：杆状，以单极毛运动或不运动；菌落形态为乳白色，透明，凸起，边缘规则，生长缓慢

大小：0.8-1.0×1.0-8.0 μm

特点：专性甲基营养菌，只能生长于除了甲醇外的 C1化合物，在甲烷中也不生长。对果糖的利用因菌株而异。严格好氧，呼吸代谢

分布范围：主要分布在水、土壤中

 

 

微杆菌属  //

图18. Microbacterium sp.（微杆菌属）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本21、22 定序为Microbacterium sp.（微杆菌属）

类别：G+菌

形状：杆状 ；菌落浅黄色，圆形，表面光滑、湿润、稍凸，不透明

大小：1-10 µm long and between 0.2-0.6 µm wide

特点：微杆菌属目前已知有40种；此类细菌特点不生孢，不抗酸。不运动或以1～3根鞭毛运动。好氧，弱厌氧。化能异养菌，以呼吸代谢为主，也可能弱发酵。利用葡萄糖和一些其他糖产酸。营养要求复杂。最适生长温度30℃

分布范围：微杆菌属的成员可以从广泛的环境中分离出来，包括土壤、昆虫、海洋环境、植物、乳制品等

 

 

赫氏草螺菌  //

图19. Herbaspirillum spp.（草螺菌属）

图源网络，仅供参考学习用

鉴定结果：样本24、25、26、29 定序为Herbaspirillum huttiense（赫氏草螺菌）

类别：G-菌

形状：螺旋型；菌落呈圆形，淡黄色不透明，表面褶皱，干燥，无晕环，无凸起，直径约1mm

大小：长度至数十微米；螺旋波长为 5-15 µm，螺旋幅度约一乃至数微米

特点：赫氏草螺菌，具有低温固氮的能力，是堆肥技术应用得以保氮固氮的优秀功能菌株之一。近年来，随着草螺菌研究的不断深入，发现草螺菌具有固氮或产生植物激素的功能并具有使宿主植物增产的潜能

分布范围：在土壤和其他自然环境中分布广泛，是土壤和植物微生态优势种群之一

  

//  小结  //

在检测的18个黑胶虫样本中，大多数细菌呈杆状，只有极个别的细菌呈丝状或螺旋型，这和观察到的大多数黑胶虫呈杆状相符。通过测序鉴定，可推测黑胶虫的身真实身份极有可能是细菌。

 

好啦~

本期分析到这里也就结束啦~

如果您也想鉴定您的细胞是否有黑胶虫污染

快来参加逍鹏生物的

“黑胶虫通缉令”吧~

- 点击此处超链接 -

 

欢迎关注公众号留言咨询，给您最合适的解决方案~

了解详细信息可戳原文，转载请标明出处。
BI 中国市场部：上海逍鹏生物科技有限公司
详情点击：阅读原文